নেত্রকোণা বিশ্ববিদ্যালয় বাংলাদেশের একটি সম্ভাবনাময় উচ্চশিক্ষা প্রতিষ্ঠান হিসেবে আত্মপ্রকাশ করেছে। এ বিশ্ববিদ্যালয়ের জ্ঞানচর্চার মূল দর্শন হলো মানবসমাজকে সামগ্রিকভাবে অনুধাবন করা। সে কারণে বিশেষায়িত শিক্ষার পাশাপাশি আন্তঃবিষয়ক ও বহুবিষয়ক জ্ঞান সৃষ্টিতে প্রতিষ্ঠানটি গুরুত্ব আরোপ করে। বিশ্ববিদ্যালয়ের লক্ষ্য এমন দক্ষ ও দূরদর্শী গ্র্যাজুয়েট গড়ে তোলা, যারা দ্রুত পরিবর্তনশীল বিশ্ব বাস্তবতায় খাপ খাইয়ে নিতে এবং নেতৃত্ব দিতে সক্ষম হবে। গবেষণায় বৈশ্বিক পরিসর বজায় রাখলেও বিশ্ববিদ্যালয়ের অগ্রাধিকার বাংলাদেশের আর্থ-সামাজিক ও জাতীয় চাহিদা পূরণে নিবেদিত।
২০১৮ সালে চারটি বিভাগ নিয়ে নেত্রকোণা বিশ্ববিদ্যালয়ের কার্যক্রম শুরু হয়। প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকেই প্রতিশ্রুতিকে বাস্তবে রূপ দেওয়ার প্রয়াস অব্যাহত রয়েছে। ২০২৪ সালে দায়িত্ব গ্রহণের পর বর্তমান উপাচার্য অধ্যাপক ড. খন্দকার আশরাফুল মুনিম এবং কোষাধ্যক্ষ অধ্যাপক ড. আনিছা পারভীন বিশ্ববিদ্যালয়ের একাডেমিক অগ্রগতির সুস্পষ্ট রূপরেখা প্রণয়নের পাশাপাশি প্রয়োজনীয় অবকাঠামো উন্নয়নে বিশেষ গুরুত্ব দিয়েছেন। বিশ্বমানের জ্ঞান উৎপাদনের পাশাপাশি হাওড় অঞ্চলের ঐতিহ্য, প্রকৃতি ও পরিবেশ সংরক্ষণে বিশ্ববিদ্যালয়টি দৃঢ়ভাবে প্রতিশ্রুতিবদ্ধ। এর অংশ হিসেবে ক্যাম্পাসে দেশীয় বৃক্ষনির্ভর পরিকল্পিত বনায়ন এবং মানুষ ও প্রকৃতির সহাবস্থান নিশ্চিত করে পরিবেশবান্ধব অবকাঠামো গড়ে তোলার উদ্যোগ গ্রহণ করা হয়েছে, যার বাস্তবায়ন ইতোমধ্যেই শুরু হয়েছে। আঞ্চলিক বাস্তবতা ও বৈশ্বিক দৃষ্টিভঙ্গির সমন্বয়ই নেত্রকোণা বিশ্ববিদ্যালয়ের স্বতন্ত্র পরিচয়কে ক্রমাগত সুদৃঢ় করে তুলছে।